Seurakunnan hengellistä työtä johtavat neljä seurakunnan vanhinta, joihin palkattu seurakuntatyötekijäkin kuuluu. Seurakunnan jäsenet muodostavat yhdistyksen nimeltä Rautavaaran Helluntailähetys ry. Se vastaa seurakunnan taloudesta ja toimitiloista ja käyttää yhdistyksen ylintä päätösvaltaa.

Yhdistyksen kokous valitsee juoksevia asioita hoitamaan hallituksen, johon kuuluu tällä hetkellä viisi jäsentä ja kaksi varajäsentä. Hallitukseen kuulumattomilla vanhimmilla on hallituksen kokouksissa puheoikeus.

Paikallinen seurakunta vastaa kaikesta toiminnasta itsenäisesti. Seurakuntalaisilla ei ole pakollisia jäsen- tai muita maksuja. Suurin osa seurakunnan tekemästä työstä on sen jäsenten tekemää vapaaehtoista toimintaa.

Vanhimmat: Ahti Alanne, Martti Hakkarainen, Veijo Miettinen ja Ilkka Roininen (pj, sihteeri).

Hallitus: Ilkka Roininen (pj), Martti Hakkarainen (vpj), Samuli Rydenfelt (taloudenhoitaja-sihteeri), Martti Pursiainen ja Rauha Partanen. 1. varajäsen Maire Parvainen ja 2. varajäsen Veijo Miettinen.

Tilintarkastajat 2010: Leea Järvinen (Helsinki) ja Sirpa Lahtinen (Iisalmi).